El tribunal supremo de Italia confirmó la sentencia definitiva a cadena perpetua para catorce represores de América del Sur, que participaron del homicidio de personas con ciudadanía italiana, en distintos operativos en el marco del Plan Cóndor.

Jorge Néstor Tróccoli, de nacionalidad uruguaya, que se desempeñó en el Cuerpo de Fusileros Navales (FUSNA) fue capturado en Italia y juzgado en el marco del proceso. El resto de los condenados lo fueron en ausencia.

En Argentina la primera causa contra el Plan Cóndor comenzó en el año 1999.

El 5 de marzo de 2013 llegó a la instancia de juicio oral acumulada junto a otras dos y con la segunda parte del expediente por los crímenes cometidos por la coordinación de fuerzas represivas argentinas y uruguayas en el centro clandestino de detención, tortura y extermino conocido como "Automotores Orletti".

El 16 de octubre de 1998, el ex dictador chileno Augusto Pinochet fue detenido bajo arresto domiciliario en una clínica de Londres (Reino Unido) donde se recuperaba de una intervención menor por una hernia discal. La orden de captura internacional la había emitido el juez español Baltasar Garzón con la intención de desarrollar un juicio por los asesinatos de ciudadanos españoles durante la dictadura chilena y el Plan Cóndor. 

Los "Archivos del Terror de Paraguay" es como se conoce a los documentos oficiales relativos a la represión policial y militar ocurrida en Paraguay durante la dictadura de Alfredo Stroessner. En ese archivo se hallaron también documentos emitidos por fuerzas policiales y militares de otros gobiernos autoritarios de la región, en particular vinculados a operativos de la coordinación represiva de Plan Cóndor.

Entre el 22 de abril y el 14 de agosto de 1985 se realizaron 78 audiencias públicas del juicio a los nueve comandantes argentinos que lideraron las Juntas Militares de la dictadura Argentina entre 1976 y 1983: Jorge Rafael Videla, Emilio Eduardo Massera, Orlando Ramón Agosti, Roberto Eduardo Viola, Armando Lambruschini,